* Különböző kazettaformátumok: A DS és a 3DS különböző kazettaformátumokat használ. A 3DS kazetta fizikailag kisebb, és különböző tűkkel rendelkezik a rendszerhez való csatlakozáshoz.
* Szoftver-inkompatibilitás: Még ha fizikailag is be tudna illeszteni egy DS játékkazettát egy 3DS-be, a 3DS rendszerszoftver nem ismerné fel. A 3DS-t 3DS játékok futtatására tervezték, nem DS játékokra.
Hogyan játssz DS-játékokat 3DS-en:
* Virtuális konzol: A 3DS rendelkezik egy „Virtual Console” funkcióval, amely lehetővé teszi a klasszikus DS játékok letöltését és digitális lejátszását. Ezek a játékok a Nintendo eShop-on keresztül vásárolhatók meg, és játszhatók 3DS-en.
* DSi mód: Néhány 3DS modell rendelkezik "DSi móddal", amely lehetővé teszi a DS-játékok közvetlen lejátszását. Ez a mód elsősorban a régebbi DS-játékokkal való kompatibilitásra szolgál, és nem tartalmazza a 3DS továbbfejlesztett funkcióit.
Megjegyzés: Fizikai DS-kazettát nem helyezhet be a 3DS-be. A 3DS ilyen értelemben visszafelé nem kompatibilis a DS kazettákkal.