Polimerizáció mechanizmus SDS gél

SDS -PAGE olyan eljárás tudósok külön fehérjék alapján hogyan vándorolnak át a gélt. A géleket készülnek a nevezett polimer poliakrilamid . Ha egy poliakrilamid gél , elkezdi keverékével vegyszerek: akrilamid, biszakrilamid , SDS-t és egy puffer , hogy stabilizálják a kémiai pH-t. Hozzáadása perszulfát vegyület és egy másik kémiai nevű TEMED hatására az akrilamid alkotnak hosszú láncok vagy polimerizálódhat . Initiation

perszulfát ion ammóniumperszulfát egyenértékű a két szulfátionok köti össze a gyenge oxigén - oxigén kötés . Ez a kötés hasítani vagy törés két , ​​hozamú szulfát gyökök --- erősen reaktív molekulák, amelyek párosítatlan elektron . A gyök -szulfát vízzel reagálhat , hogy létrehoz egy hidroxil gyök , vagy reakcióba léphet a monomer akrilamid , hogy elindítsa a polimerizációs reakciót. TEMED katalizátorként működik , amely felgyorsítja az arány, amely persulfate ionok gyököket.
Chain Reaction

Amint a hidroxil-vagy szulfát gyök képződött , megtámadja akrilamid monomer , akik egy az elektronok a kettős kötés. Az akrilamid monomer most egy radikális párosítatlan elektron, ez ​​így megy tovább, hogy megtámadja a másik monomer akrilamid hasonló módon. Ez a sorozat az események létrehoz egy gyorsan növekvő lánc akrilamid monomerek kapcsolódnak egyszeres kötéssel . A láncreakció csak akkor ér véget, amikor két gyökök reakcióba lépnek egymással.
Határon összekapcsolása

Ha akrilamid jelen voltak a saját , akkor nem alkotnak a vastag gél , amire szükség van a SDS -PAGE . A polimerek kell legyen ahhoz, térhálós alkotnak gélt a megfelelő tulajdonságokkal , és ez az, ahol biszakrilamid jön be A kettős kötést is szolgálhat biszakrilamid célpontja gyökök a reakció, és mivel két oldalak, ahol lehet megtámadta a radikálisok , ez végül is bekerült a két növekvő polimer . Következésképpen a polimerek keresztkötések végén közöttük véletlenszerűen oldalak mentén a hossza az egyes lánc .
Szempontok

A polimerizációs reakció nagyon gyors , így ha egyszer ' ve hozzá a TEMED és perszulfát , akkor kerül sor , nagyon gyorsan. A tisztaság a reagensek azért fontos, mert szennyező anyagok befolyásolhatják az eredményeket . Akril -sav, például adhatunk a polimerhez , és létrehoz ioncserélő helyek , hogy okozhat a helyi pH- különbségek a gélt. Az eredményül kapott gél még tartalmazhatnak akrilamid monomer , és az akrilamid egy neurotoxin , így mindig a megfelelő óvintézkedéseket, amikor dolgozik az SDS gél .