Vizsgálja meg a GC -tartalom ( több G és C -k) a primer sorrendben . GC kötés erősebb, mint az AT kötés , mert a további hidrogénkötés között a guanin és a citozin . Optimális kötés legalább 50 százalék GC tartalma .
2
Vizsgálja meg a hőkezelés hőmérséklet a reakció . Alacsony lágyítási hőmérséklet , általános meghatározás szerint 55 ° C vagy az alatti , okozhat nem- specifikus kötődését a primer , amely okozhat primer dimerek mellett amplifikációs helytelen genomiális szakaszok.
3
Kettős -Ellenőrizze mennyiségének és koncentrációjának primerek meg hozzá a PCR . A túlzott alapozók, általában több mint 75 picomoles okozhat primer dimerek is.